Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms