Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DBX1A6NMT0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms