Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms