Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms