Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F8A0AVK6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms