Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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