Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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COL24A1Q17RW2 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SLIT2-203ENST00000503837 4752 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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