Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CENPPQ6IPU0 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CENPPQ6IPU0 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms