Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TCOF1Q13428 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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TCOF1Q13428 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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TCOF1Q13428 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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