Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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