Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FAM182A-201ENST00000376398 5070 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ABCC11-202ENST00000356608 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NTRK2-204ENST00000359847 6646 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OPCML-207ENST00000541867 6277 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HERC2P2-201ENST00000613386 5181 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SMARCA2-263ENST00000637806 7061 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF259P1-202ENST00000572422 4912 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RASSF2-201ENST00000379376 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC027319.1-201ENST00000591657 511 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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