Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 ETFBKMT-203ENST00000412352 1083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
USP35Q9P2H5 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms