Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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HDDC3Q8N4P3 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HDDC3Q8N4P3 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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