Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC104699.1-201ENST00000352271 414 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC079584.1-201ENST00000426716 464 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL606490.2-201ENST00000457562 1330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms