Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC115837.1-201ENST00000517662 1001 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
COL24A1Q17RW2 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms