Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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