Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 C8orf87-201ENST00000521906 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC005479.1-201ENST00000554629 451 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC02178-201ENST00000566876 425 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL136141.1-201ENST00000605780 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 B4GALT6-203ENST00000383131 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC090539.2-201ENST00000523425 671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms