Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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