Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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