Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 IPO7P2-201ENST00000451446 1750 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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