Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AGAP9Q5VTM2 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms