Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRHR-202ENST00000518632 1660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PSG9-203ENST00000291752 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 GPN2-201ENST00000374133 715 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL121990.1-201ENST00000417605 591 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC018641.1-201ENST00000435950 796 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 FUNDC2P4-201ENST00000441207 421 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL357037.1-201ENST00000454758 322 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC021006.2-201ENST00000526978 859 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC126773.1-201ENST00000569654 547 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC009121.2-201ENST00000572913 714 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 IGKV3OR2-5-201ENST00000605851 281 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 DCLRE1C-203ENST00000378242 1933 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR8G3P-203ENST00000641848 1344 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 DEFB104A-201ENST00000314265 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 DEFB104B-201ENST00000316169 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MOSPD1-201ENST00000370777 784 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ST13P13-201ENST00000417082 1092 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPS23P8-201ENST00000429775 330 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC239727.1-201ENST00000431432 623 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LYZL4-202ENST00000441172 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRBV21-1-201ENST00000453262 348 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms