Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms