Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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PTPRMP28827 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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