Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQE9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQE9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQE9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms