Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC61Q9Y6R9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC61Q9Y6R9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms