Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms