Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
DCAF1Q9Y4B6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms