Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP3Q9Y446 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms