Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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HCN4Q9Y3Q4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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HCN4Q9Y3Q4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN4Q9Y3Q4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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