Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms