Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms