Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms