Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms