Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms