Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms