Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms