Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms