Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms