Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms