Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms