Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SFMBT1Q9UHJ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms