Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms