Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms