Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms