Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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