Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms