Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms