Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms