Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms